昌马石窟原有石窟24座，石窟内壁画的颜色多以青、绿、红三色为主，尤其以石绿居多。大多数菩萨的形象都为男性，脸部画有胡须，而且多为露齿菩萨，该现象在其它壁画中不多见。从洞窟壁画和雕塑内容来看，大多反映了当时的社会生产以及生活状况，对研究当时的民族关系、历史文化、民间习俗以及佛教传播都有着重要的作用。

青蛙变蝌蚪5月17日，甘肃省玉门市昌马石窟内，工作人员进行造像和壁画数据检测复核工作。据玉门官方透露，昌马石窟造像和壁画数字化扫描及艺术品复原将于近日完工，并以学术研究成果转化的方式完成保护数据修复与复原展示工作。该石窟最早建于南北朝时期，与敦煌莫高窟、瓜州榆林窟同属姊妹窟，2019年被中国国务院公布为第8批全国重点文物保护单位。