地震发生后，铁路部门迅速启动应急预案，有效应对地震影响。一是及时扣停在途列车，封锁线路，组织人员和机具上线检查线路设备设施。二是调整运输组织，在确认线路设备安全的前提下，以最快速度开通线路。三是加强站车旅客疏导，与市政交通做好接驳，防止旅客滞留。四是加强旅客服务，组织免费退票，及时推送列车动态信息，保障食品和饮用水供应。

截至4月3日18时，共有189列旅客列车停运，杭深高铁、甬广高铁、金温高铁、合福高铁等线路部分旅客列车不同程度晚点运行，主要车站没有发生旅客滞留。预计到今天夜晚，运输秩序将全部恢复。4月4日，旅客列车开行不受影响。

色色综合4月3日7时58分，台湾花莲县附近海域发生7.3级地震，我国东南沿海地区20余条铁路线路、1000余列旅客列车受到影响。