发言人表示，有关规定适用于所有因被裁定犯危害国家安全的罪行而正在服刑的囚犯，不论其刑罚是在有关修订生效之前、当日或之后判处的。刑期的执行一向属于行政机关的职权范围，惩教署署长考虑个案的实际情况和包括在囚人士的申述在内的所有相关因素，严格依照法律赋予的权力执行职务以及行使其酌情权，确保所有个案获公平处理。

发言人表示，过去，香港曾发生因犯危害国家安全罪行而被定罪的囚犯在提早获释的监管期间潜逃或继续进行危害国家安全的行为和活动。为维护国家安全和保障公众，有必要就涉及危害国家安全罪行的囚犯能否提早获释施加较为严格的限制。有关安排并未改变法庭对触犯危害国家安全罪行的人作出的判刑，因此不存在所谓“变相加刑”的问题。

宝藏2016特区政府发言人强调，在《维护国家安全条例》生效前后，囚犯从来都无必然权利获得提早释放。特区政府惩教署署长的职责是严格执行法庭就每个囚犯所判处的监禁刑罚，任何准予囚犯提早释放的酌情权必须根据法律的规定行使。

发言人解释，《维护国家安全条例》对《监管释囚条例》和《监管释囚规例》作出的修订是，如某囚犯是因被裁定犯危害国家安全的罪行而服刑，除非惩教署署长相信提早释放该囚犯不会不利于国家安全，否则不得将该囚犯的个案转介予监管释囚委员会考虑。同样地，修订后的《监狱规则》也订明，如某囚犯是因被裁定犯危害国家安全的罪行而服刑，除非惩教署署长相信该囚犯获减刑不会不利于国家安全，否则该囚犯不得根据相关规则获减刑。